František Fajtl se narodil Františku a Marii Fajtlovým v srpnu 1912 v obci Donín na Lounsku. Měl dvě starší sestry. Po dokončení základní školní docházky začal v roce 1928 studovat na České obchodní akademii v Teplicích, kde také v roce 1932 maturoval. Poté nastoupil na povinnou vojenskou službu. Stal se příslušníkem pěšího pluku č. 9 Karla Havlíčka Borovského v Mostě.